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circRNA研究匯總|20190520-20190526
來源: | 作者:geneseed | 發布時間: 2019-05-27 | 139 次瀏覽 | 分享到:

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刀塔自走棋段位花呗 www.zjrpd.icu 歡迎各位來到“circRNA研究報道匯總”欄目,本期從pubmed中檢索收集最新發布的circRNA文獻18篇,下面我們一起來看看circRNA研究最近有哪些新進展。

 

1、人背外側前額皮質環狀RNA表達及相關數量性狀基因座檢測研究

論文標題:Detection of circular RNA expression and related quantitative trait loci in the human dorsolateral prefrontal cortex.

雜志:Genome Biol. 影響因子:13.214

通訊作者:楊恩策(北京大學健康科學中心)

基因突變對基因表達調控和疾病表型都有著重要的影響,那么突變對circRNA是否有影響呢?答案是肯定的,但這方面研究還很少,該文從circRNA角度深入探討了數量性狀位點QTL對circRNA表達和疾病影響。研究者首次提出了circQTL概念(指與circRNA表達變化相關聯的SNPs),對589例人背外側前額皮質樣品的circRNA進行了系統地分析,通過circRNA的表達與順式調控 SNPs (cis-acting SNPs)關聯分析,識別到了 196,255 個circQTL,進一步將circQTL 、GWAS Catlog 疾病與性狀 SNP數據進行共定位,發現max-circQTL SNPs(與每個circRNA表達變化最顯著關聯的SNP)顯著富集到精神分裂癥(SCZ),其他比較顯著的疾病還包括炎性腸?。↖BD)和二型糖尿?。═2DM)等,但大量circQTLs(~90%)的功能與作用機制仍需進一步探究,非常值得挖掘。本文獻深入解讀詳見歷史文章:Genome Biology | 環狀RNA數量性狀位點(circQTL)

 

圖注:circQTL SNPs GWAS Catlog 疾病類別共定位分析,發現max-circQTL SNPs(與每個circRNA表達變化最顯著關聯的SNP)顯著富集到各類疾病風險比統計圖,其中精神分裂癥(SCZ)的關聯位點最顯著。

2、源自SLC34A2-ROS1融合基因的環狀RNA F-circSR促進非小細胞肺癌細胞遷移

論文標題:Circular RNA F-circSR derived from SLC34A2-ROS1 fusion gene promotes cell migration in non-small cell lung cancer

雜志:Mol Cancer. 影響因子:7.776

通訊作者:彭勇(四川大學華西醫院)

四川大學華西醫院彭勇教授在融合環狀RNA方向已發表多篇研究論文,此次是彭勇教授的又一融合circRNA研究新發現。非小細胞肺癌中SLC34A2-ROS1融合基因產生的融合原癌蛋白可激活下游JAK/STAT,PI3K/Akt and RAS/RAF信號通路,促進非小細胞肺癌細胞增殖。首先研究者推測SLC34A2-ROS1融合基因可能產生融合環狀RNA——F-circRNA, 提取非小細胞肺癌細胞系HCC78的總RNA 后用RNase R消化,然后用融合基因位點的divergent引物進行RT-PCR。電泳鑒定到兩種circRNA,對應的分別稱為F-circSR1(由SLC34A2外顯子2-4ROS1外顯子32-42反向拼接形成),F-circSR2(由SLC34A2外顯子2-4ROS1外顯子34-37反向拼接形成),F-circSR1表達豐度更高。進一步在H1299A549細胞中分別過表達或干擾F-circSR1F-circSR2,細胞增殖,侵襲等等實驗結果顯示,兩種circRNA均可促進癌細胞侵襲,但對細胞增殖影響不明顯。本文獻深入解讀詳見歷史文章:Molecular Cancer雜志再發彭勇教授融合基因來源circRNA文章。

 

圖注:融合環狀RNA——F-circSR鑒定;a~b:SLC34A2-ROS1融合基因產生F-circSR融合環狀RNA結構示意圖;c:RT-PCR電泳和sanger測序鑒定SLC34A2-ROS1融合基因;d:RT-PCR電泳和sanger測序鑒定F-circSR融合環狀RNA。

 

3、靶向心肌細胞中高度豐富的環狀RNA circSlc8a1減弱了超負荷壓力引起的心肌肥大

論文標題: Targeting the highly abundant circular RNA circSlc8a1 in cardiomyocytes attenuates pressure overload induced hypertrophy

雜志:Cardiovasc Res. 影響因子:6.29

通訊作者:Roger Foo(新加坡國立大學)

 

之前已有多項研究表明在人和小鼠心臟心肌細胞中存在大量特異表達的circRNAs,該研究鎖定來自鈉鈣交換基因——Slc8a1,2號外顯子來源的表達豐度非常高的circSlc8a1為研究對象,探討其在心臟中的作用。研究者設計了circSlc8a1生物素標記的探針,pulldown實驗捕獲下circSlc8a1結合的miRNAs,LNA-miRNAs qPCR掃描了752miRNA分子,結合熒光素酶報告基因實驗,最終發現circSlc8a1和miR-133結合行駛功能,體內AAV9介導circSlc8a1干擾敲低后,可減弱心臟超負荷壓力引起的心肌肥大,機制研究表明circSlc8a1是通過海綿樣吸附miR-133靶向血清反應因子(SRF),結締組織生長因子(CTGF),腎上腺素受體β1(Adrb1)和腺苷酸環化酶6(Adcy6)等發揮作用。因此circSlc8a1可成為治療心肌肥大的潛在治療靶點。

 

圖注:小鼠模型中,AAV9干擾circSlc8a1后作用機制示意圖。

 

4、Hsa_circ_0009361充當miR-582的海綿,通過調節APC2表達來抑制結腸直腸癌的進展

論文標題: Hsa_circ_0009361 acts as the sponge of miR-582 to suppress colorectal cancer progression by regulating APC2 expression

雜志: Clin Sci (Lond) 影響因子:5.22

通訊作者:Changping Wu & Jingting Jiang(蘇州大學附屬第三醫院)

該研究通過在30對結腸癌患者組織標本中通過高通量測序和qPCR驗證篩選到Hsa_circ_0009361,Hsa_circ_0009361在結腸癌中顯著低表達,低表達的Hsa_circ_0009361結腸癌細胞增殖和侵襲能力增強,進一步體內外機制實驗研究表明,Hsa_circ_0009361可通過競爭性吸附miR-582靶向APC2表達來抑制結腸癌的惡化,提示Hsa_circ_0009361可作為結腸癌的潛在治療靶標。

 

 

圖注:體內實驗表明過表達Hsa_circ_0009361可抑制結腸癌的增殖和轉移。A. 第25天,三組異種移植裸鼠的切除腫瘤。 B.在25天過程中監測腫瘤體積。C.在研究結束時測量腫瘤重量。 D. qRT-PCR檢測腫瘤組織中的hsa_circ_0009361,miR-582和APC2表達水平。E.H&E染色, APC2、E-鈣粘蛋白和β-連環蛋白的組織形態和IHC染色。 F.肺轉移性結節的代表性圖片,比較三組間肺轉移結節的數量。

 

 

參考文獻列表