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Molecular Cancer雜志再發彭勇教授融合基因來源circRNA文章
來源: | 作者:geneseed | 發布時間: 2019-05-27 | 107 次瀏覽 | 分享到:

524日,Molecular Cancer雜志在線發表了四川大學華西醫院彭勇教授的一項最新研究工作,介紹發現SLC34A2-ROS1融合基因來源的circRNAF-circSR1  F-circSR2)可促進肺癌細胞侵襲[1]。彭勇教授也是今年第五屆circRNA研究論壇邀請的主講嘉賓之一,歡迎各位同仁屆時參加。

 

彭勇教授之前也曾發表過肺癌中融合基因來源的circRNA功能研究的文章,下面我們一起學習一下本文:

如何發現SLC34A2-ROS1融合基因來源的circRNA

非小細胞肺癌細胞系HCC78攜帶兩種SLC34A2-ROS1融合基因:SLC34A2基因的外顯子1-4分別與ROS1基因的32-4334-43外顯子融合形成(GenBank IDEU236946.1  EU236947.1)。為鑒定兩種SLC34A2-ROS1融合基因對應的circRNA。作者首先將總RNA RNase R消化,然后用融合基因位點的divergent引物進行RT-PCR。電泳鑒定后分別從兩種融合基因中擴增到兩種circRNA,對應的分別稱為F-circSR1(由SLC34A2外顯子2-4ROS1外顯子32-42反向拼接形成),F-circSR2(由SLC34A2外顯子2-4ROS1外顯子34-37反向拼接形成)。電泳結果還顯示F-circSR1表達豐度更高。

 

1 SLC34A2-ROS1融合基因來源circRNA鑒定 ([1]

 

SLC34A2-ROS1融合基因來源的circRNA促進NSCLC細胞侵襲

H1299A549 中分別過表達或干擾F-circSR1F-circSR2,分析它們對細胞增殖,侵襲等表型的影響。結果顯示兩種circRNA均可促進侵襲,但對細胞增殖影響不明顯。


 

2  SLC34A2-ROS1融合基因circRNA促進侵襲 ([1]

 

側翼內含子促進SLC34A2-ROS1融合基因來源的circRNA生成

反向拼接位點兩側的側翼內含子需要對circRNA的形成至關重要,作者接下來探索了兩種SLC34A2-ROS1融合基因circRNA對應的側翼內含子序列在對應circRNA形成過程中的作用。序列分析表明F-circSR1的側翼內含子序列互補效率明顯高于F-circSR2的側翼內含子,將對應的互補序列構建GFP報告基因結果也表明F-circSR1的側翼序列能更有效的促進成環(該報告系統是將GFP基因拆分為兩段,上下游互換位置,如果對應的序列能夠準確環化,則可表達正確的GFP蛋白,否則不能表達完整的GFP蛋白)。

 

3 側翼內含子促進SLC34A2-ROS1融合基因circRNA形成 ([1]

 

本文的故事相對較簡單,但目前關于融合基因來源的circRNA研究相對較少,因此也有重要的科學意義。

參考文獻

1. Wu, K., et al., Circular RNA F-circSR derived from SLC34A2-ROS1 fusion gene promotes cell migration in non-small cell lung cancer. Mol Cancer, 2019. 18(1): p. 98.