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圓滿落幕 | 第四屆circRNA研究論壇
來源: | 作者:geneseed | 發布時間: 2018-07-10 | 3590 次瀏覽 | 分享到:



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2018年7月7日-8日,第四屆circRNA研究論壇廣州翡翠皇冠假日酒店成功舉辦!本次論壇得到了廣州市生物產業聯盟、廣州開發區高層次人才協會、廣州市領軍人才開發學院的大力支持,由廣州吉賽生物科技股份有限公司精心策劃和承辦。為期兩天的科學盛會,不僅有15位circRNA領域的杰出科學家帶來精彩報告和分享,還有海內外頂尖科研院所醫院一線科研工作者交流探討,行業內精英企業媒體朋友匯聚一堂,盛況空前!


本次論壇,主要就circRNA 臨床最新研究進展;circRNA 與疾病關系最新研究進展;circRNA 翻譯蛋白研究策略分析;circRNA 研究技術與工具;circRNA m6A甲基化研究策略;疾病/組織特異circRNA 篩選、鑒定及功能研究六個議題展開了最豐富最前沿的討論。



論壇會場盛況


接下來,請各位老師跟隨小編的腳步,一起回顧這一年一度的科學盛會吧!



香港中文大學醫學院

陳揚超  研究員


陳揚超研究員帶來了題為“circular RNAs with critical roles in pancreatic ductal adenocarcinoma”的研究報告。胰腺導管癌(PDAC)中盡管已有諸多蛋白標志物報道,如KRas,p53,p16和DPC4等,但在過去20年中,患者的總體存活率幾乎沒有改善,因此,鑒定新的診斷標志物和治療靶點具有重要意義。陳老師課題組在胰腺癌中共發現了169種circRNA具有顯著性的表達差異,驗證了兩種circRNA(circG和circR)在PDAC細胞系和原發腫瘤組織中顯著上調,circG很有可能可作為胰腺癌腫瘤標記物,通過敲低這兩種circRNA,發現其能顯著抑制PDAC細胞生長。



中山大學附屬第一醫院

張弩  副教授


張弩副教授帶來了題為“Targeting a novel circRNA encoded EGFR activator in Glioblastoma Therapy”的報告。他報道發現了一種由circRNA編碼的特殊多肽,由circRNA滾環翻譯產生出了獨一無二的特殊尾巴序列,張教授研究表明這段序列恰好是EGFR-VIII突變型的配體分子,解釋了困擾多年的EGFR-VIII突變型如何持續激活的問題,未來有望為開發針對攜帶EGFR-VIII突變型的腦膠質瘤患者的靶向藥物和治療方法。



美國加州大學

丁向明 研究員


丁向明研究員及其團隊開發了一個全新的circRNA數據庫--circBank。這個數據庫也于論壇當天上線發布,網站如下://www.circbank.cn/,這是一個人源circRNA的綜合數據庫,共收錄了140790條人類circRNA的數據,采用了全新的更加實用的ID編號系統,提供了circRNA染色體坐標,提供了人鼠保守型分析及對應序列,提供了circRNA翻譯蛋白潛能預測評估,提供了保守性和對應序列突變信息,收錄了已報道circRNA轉錄后修飾信息,能直接獲得結合miRNA的預測分析結果。

更多詳情可查看往期文章:重磅!人類環形RNA數據庫circBank正式上線




中山大學腫瘤防治中心

左志向 副教授

左志向副教授帶來了題為“circRNA在惡性腫瘤的異常調控和臨床應用”的精彩報告。治療后復發是中期結腸癌病人死亡的主要原因,臨床上缺乏預測中期結腸癌復發的有效指標。circRNA的高穩定性使其具有作為分子標記物的潛在價值。左教授團隊開發了一套基于轉錄組測序的circRNA鑒定框架,從20對復發和未復發腫瘤組織中鑒定出近百個差異表達的circRNA。利用QPCR對來自多個中心的近600例中期結腸癌樣本進行circRNA定量,并采用基于機器學習的LASSO算法篩選并構建了一個由多個circRNA構建風險分數cirScore。驗證結果表明,該分數可獨立并有效的區分高復發風險患者。此外,功能試驗表明,這些circRNA可顯著影響腸癌細胞的增殖和遷移。


東南大學醫學院

姚紅紅 教授

姚紅紅教授帶來了題為“Circular RNA and Neuroinflammation-Implications for stroke therapy”的精彩報告。circRNA在中樞神經系統中高度表達,并參與生理和病理生理過程的調節,然而,circRNA在中風中的潛在作用仍然很大程度上未知。姚教授團隊發現在tMCAO小鼠中風模型的缺血性腦組織中circular RNA HECTD1的表達水平顯著提高,并且在急性缺血性中風患者的血漿樣本中進一步驗證了這一發現。敲除circHECTD1表達顯著降低梗塞面積,減弱神經元缺陷,并改善tMCAO小鼠中的星形膠質細胞活化。 circHECTD1及其偶聯機制與腦缺血有關,從而提供了轉錄證據,即circHECTD1可作為中風的新型生物標志物和治療靶點。


廈門大學翔安醫院

陳敏 研究員

陳敏研究員帶來了題為“新型預后標志物circTADA2As通過調控miR203/SOCS3軸抑制乳腺癌細胞增殖及轉移的研究”的精彩報告。與正常乳腺上皮細胞中表達相比,篩選出的circTADA2A在不同分子分型乳腺癌組織和細胞系中均表達下調,并且circTADA2A的表達量越低,分期越高,淋巴結轉移數越多。circTADA2表達低的病人無疾病生存期和總生存期越短。circTADA2A高表達可抑制乳腺癌細胞的增殖、克隆形成、劃痕愈合、侵襲能力,以及異種移植瘤動物的乳腺癌細胞生長。報告基因、熒光原位雜交、蛋白印記研究結果顯示,circTADA2A可以吸附miR203,進而調控SOCS3表達,影響乳腺癌細胞的克隆形成能力。此研究揭示了乳腺癌中circRNA差異表達譜,發現circTADA2A為乳腺癌潛在生物靶點,為乳腺癌的診斷、治療提供新的理論基礎。


中科院-馬普學會計算生物學伙伴研究所

王澤峰課題組  樊曉娟 博士

樊曉娟博士分享了題為“De novo Screen of Internal Translation Initiation Elements in circRNA”的精彩報告。王澤峰教授團隊早期研究報道發現基于m6A修飾的circRNA翻譯起始機制,他們在此基礎上嘗試分析可能介導circRNA翻譯起始的調控元件。報告中樊博士介紹他們基于文庫篩選,系統的鑒定了一些circRNA中的IRES-like elements,發現了多種的IRES-like elements能驅動circRNA的翻譯,這也可能是circRNA的一個普遍功能。


寧波大學醫學院

郭俊明 教授

郭俊明教授分享了題為“環狀RNA與胃癌診斷”的研究報告。胃癌是我國常見惡性腫瘤,但目前尚無理想的診斷方法。郭教授團隊以胃癌作為研究對象,采用circRNA芯片技術結合生物信息學分析手段,在組織和血漿2個層面揭示了胃癌相關circRNA的表達譜,然后在基于熒光染料法微滴式數字PCR的基礎上對胃癌相關circRNA進行鑒定,最后探究血漿circRNA作為胃癌分子標志物的臨床診斷價值。


廣東醫科大學檢驗學院

徐軍發 教授

徐軍發教授帶來了題為“circRNAs in Tuberculosis: Expression profile and function on macrophage autophagy”的精彩報告。徐教授分享了細胞自噬是機體抗結核免疫的重要機制,研究發現結核菌感染損傷巨噬細胞自噬,但其機制不清。circRNA可參與對免疫細胞活性的調控。其團隊通過高通量circRNA測序,發現活動性肺結核患者與正常人外周血單個核細胞中存在大量的差異表達circRNA,其中circTRAPPC6B在單核/巨噬細胞中表達顯著下調,過表達circTRAPPC6B可促進Mtb感染巨噬細胞自噬,且生物信息學分析表明circTRAPPC6B可與自噬相關miRNA或蛋白互作,以上結果提示結核菌感染可能通過誘導巨噬細胞中circRNA的表達而參與調節巨噬細胞自噬。


中國科學技術大學

陳亮 副研究員

陳亮副研究員分享了題為“A p63 related circular RNA in cervical cancers”的研究報告??翁庾櫸⑾忠恢謈ircRNA新的機制--circRNA能調控母基因的轉錄,還介紹了p63相關circRNA在宮頸癌中的作用,敲除這個相關基因會增加細胞增殖和遷移,抑制腫瘤發生進程。陳博士結合自己在circRNA互作分子研究過程中的心得,與大家分享了如何研究circRNA互作分子的一些經驗。


加拿大多倫多大學

楊柏華 教授

楊柏華教授分享題為“Suppression of YAP expression by circ-YAP”的精彩報告。YAP相關蛋白在腫瘤發生中起關鍵作用。楊教授團隊發現過表達circ-YAP能顯著降低YAP蛋白的翻譯水平,但不影響其mRNA水平,因此懷疑circ-YAP可能影響了YAP蛋白的翻譯。進一步的機制研究表明circ-YAP通過結合翻譯起始相關的蛋白阻止了YAP的翻譯作用,并且這種作用也基于circ-YAP與YAP的mRNA的相互作用,因此是特異性的影響YAP基因的機制。值得注意的是,來自患者的乳腺癌組織表現出circ-YAP表達的失調。楊教授的報告揭示YAP調控的分子機制,并暗示circRNA的新功能,circ-YAP可能作為未來癌癥干預的潛在工具。


北京市神經外科研究所

袁芳課題組 陳燁老師

陳燁老師代表袁芳教授課題組帶來了“circRNA在神經系統疾病中的研究進展”的研究報告。其課題組在小鼠和人類等哺乳動物大腦中發現了大量相對保守、豐度高于對應線性RNA的circRNA,而且這些circRNA呈現出細胞類型與分化狀態特異的表達特征,基于這些特異性,circRNA的發現為神經系統疾病的診斷治療提供了新思路。


海軍軍醫大學基礎醫學院

韓丹 博士

曹雪濤院士課題組的韓丹博士分享了題為“Circular RNA MTO1 suppress the progression of hepatocellular carcinoma(HCC) by blocking miR-9's cancer promoting effect”的精彩報告。circMTO1作為miR-9的sponge促進p21表達,從而抑制肝癌的發生,表明circMTO1是肝癌治療的潛在靶標。肝癌組織中circMTO1的減少可以作為患者生存率低的預測因子。該成果已于2017年在《HEPATOLOGY》上發表。


中山大學生命科學院

楊建華 教授

楊建華教授分享了題為“Discovering the CircRNA Interactions with RNA-Binding Proteins and Ribosomes”的研究報告。其團隊開發了一個新的算法circScan,能夠在CLIP-seq和Ribo-seq測序數據中準確地鑒定circRNA。在人和鼠中大規模地鑒定了成千上萬的circRNA與100多個RBP互作。實驗驗證了多個新的circRNA能夠與AGO和IGF2BP2蛋白結合。揭示很少circRNA能成為super-sponge??tarScan預測sRNA切割circRNA。鑒定了20個circRNA與eIF3結合,實驗驗證多個能夠成環并與ribosome和m6A互作。鑒定20個候選的circRNA具有翻譯潛能,極少數circRNA能翻譯成蛋白。揭示最全面的circRNA-RBP互作網絡。


廣州吉賽生物科技股份有限公司

黃寧寧 技術部經理

黃經理給我們介紹了“circRNA過表達系統開發應用及經驗分享”,早在2015年,吉賽生物已申請并授權circRNA過表達載體國家發明專利。此次分享通過對circRNA的形成機制剖析,介紹了吉賽生物對circRNA過表達系統的開發、優化歷程。circRNA過表達具體方法詳解,常用過表達載體介紹以及過表達慢病毒、腺相關病毒的應用。文章實例解析circRNA過表達在功能研究中的應用和circRNA研究策略。

除了以上15個精彩報告之外,論壇還專門設置了嘉賓集體交流環節,嘉賓老師和參會代表深度交流互動,將論壇一次次推向高潮,許多老師在茶歇和休息時間也把握了難得的提問機會,我們可親可敬的嘉賓老師都一一解答和交流!


難忘瞬間




提問瞬間  深入探討






火熱交流  思維碰撞



贊助企業展臺咨詢火爆



至此,第四屆circRNA研究論壇圓滿落幕,希望我們搭建的這個交流活動平臺能夠真正的加深circRNA研究的交流,并且能夠引領circRNA研究的發展!再次感謝各位嘉賓以及參會老師支持和蒞臨!2019年7月7日-7月8日,我們第五屆circRNA研究論壇再會!